发芽的大蒜最好不要生吃，在烹饪前需要将其处理干净。大蒜是一种天然的抗生素和抗氧化剂，但大蒜发芽后可能会产生一些有害的物质。例如，发芽的大蒜可能会产生一种名为丙硫氨酸的天然毒素，会对人体造成一定的损害，特别是在大量摄入的情况下。
另外，发芽的大蒜表面可能会有细菌和真菌滋生，这些物质可能会对人体健康造成风险。因此，建议在食用发芽的大蒜前，将其外面的薄膜、头和尾部去掉，切成小块后再用油进行烹饪，或者将其浸泡在盐水或醋里，使其消毒后再食用。此外，如果发芽的大蒜外表有银色膜、变软或变*，或者有奇怪的异味，就应该避免食用，因为这可能表示大蒜已经腐烂或者受到污染。